Im Gegensatz zu Linux Mint 14 basiert Linux Mint LMDE auf Debian anstatt auf Ubuntu. Letzteres basiert zwar auch auf Debian, ist aber nicht durchgängig kompatibel mit dem Linux-Urgestein. Das jetzt freigegebene LMDE 201303 bringt die beiden von Gnome 3 abgeleiteten Desktops Cinnamon und Mate in 32- und 64-Bit Versionen mit.