Analogue hat für das 3D ein umfangreiches Firmware-Update veröffentlicht. Version 1.3.0 führt neben von Nintendo-64-Fans lange gewünschten Funktionen unter anderem „Memories“ ein, womit die Konsole erstmals ein Save-State-System erhält. Darüber hinaus bringt das Update zahlreiche weitere Verbesserungen mit sich.
