Ein Update auf iPhone OS 3.1 kann bei Verwendung eines iPhone der ersten Generation oder eines iPhone 3G zu Problemen beim Verbindungsaufbau mit Exchange Server 2007 führen. Laut Apple liegt die Ursache dafür nicht in dem Update für das Handybetriebssystem. Vielmehr behebe iPhone OS 3.1 einen Fehler in der Vorgängerversionen.